En 1992 el museo adoptó el nombre del arquitecto alemán Leopoldo Rother (1894-1978), quien en 1938 se vinculó por primera vez a la actividad docente en la Facultad de Arquitectura de la Universidad Nacional. Como sede para el Museo de Arquitectura se escogió la edificación diseñada por el mismo Rother para albergar la imprenta de la universidad y que fue readecuada con este fin. En la actualidad en este museo se conserva el archivo documental de varios arquitectos nacionales y extranjeros como el del mismo Leopoldo Rother, de los italianos Vicente Nasi y Bruno Violi y de los colombianos José María Montoya Valenzuela y Fernando Martínez Sanabria.

Una visera de hormigón armado, levemente inclinada y apoyada sobre dos esbeltos pilares cilíndricos, sirve de acceso a esta edificación, en la que no obstante su uso industrial original, Rother puede apelar a esa racional sensualidad que también pone en evidencia en sus trabajos de la misma época para el Centro Cívico de Barranquilla (1945) o el edificio de Mercado en Girardot (1946-1948).

Una sinuosa rampa-escalera lateral conduce al espacio central, actualmente destinado como área de exposiciones, donde las dos curveadas cáscaras de hormigón armado, con su estructura a la vista, que le sirven de cubierta, se entrecruzan en direcciones opuestas, definiendo una franja de iluminación indirecta, mientras se apoyan sobre una línea continua de pilares cilíndricos. En el nivel exterior se destaca la fachada principal de acceso, que rítmicamente se compone por delgados pilares que enfatizan las líneas verticales y enmarcan superficies acristaladas que dotan de liviandad y transparencia al conjunto.